|
Post by Jian Yang on Oct 20, 2016 17:52:15 GMT
Yes, you can. You just need to specify the number of autosomes using the option --autosome-num when creating the GRM. For example:
gcta64 --bfile test_dog --autosome-num 38 --autosome --make-grm --out test_dog
or
gcta64 --bfile test_dog --autosome-num 38 --chr 1 --make-grm --out test_dog_c1 gcta64 --bfile test_dog --autosome-num 38 --chr 2 --make-grm --out test_dog_c2 ...... gcta64 --bfile test_dog --autosome-num 38 --chr 38 --make-grm --out test_dog_c38
or
gcta64 --bfile test_dog --autosome-num 38 --make-grm-xchr --out test_dog_xchr
|
|